高複雜性 AS 事件在哺乳動物物種中普遍存在 為了調查具有高剪接複雜性的國家電子郵件列表事件的普遍性，利用來自六種哺乳動物（人類、黑猩猩、大猩猩、獼猴、小鼠、負鼠）的六種組織（大腦、小腦、心臟、肝臟、腎臟、睪丸）的公開 RNA-seq 資料）和雞（表 S 1）[ 31 ]，我們首先計算了 Whippet 表達的蛋白質編碼基因中所有型別事件的 Ψ 值和剪
接複雜度（Ψ 相關熵）[ 18]。值得注意的是，Whippet 使用“連續剪接圖”（CSG）來估計每個 AS 事件的 Ψ 值。與傳統的二元事件相比，Whippet 中的 AS 事件可以具有任何複雜性，其被定義為 CSG 中節點（非重疊外顯子序列）的跳躍或連線邊緣的集合集（圖 S 1 A ）。在 Whippet 中，有八種主要的節點型別（圖 S 1B)，即選擇性受體剪接位點(AA)、(AD)、選擇性第一外顯子(AF)、選擇性最
發表於 2023-7-17 18:46:06
